罗氏发射GS FLX +系统软件更新

罗氏宣布全球推出一个新的软件更新,极大地扩展了可用的扩增子的长度范围为下一代测序研究454 GS FLX +目标系统。

最新的软件使序列的扩增子800个基点,同时保持对读取的长度> 99%的准确率。

高质量测序更长时间的扩增子1100年初英国石油公司成功演示了访问测试。

长阅读改进允许研究人员获得更完整的覆盖目标基因的区域使用更少的扩增子,简化实验设计和改善生物测序结果的相关性。

“这是另一个步骤在我们继续努力推动高质量、长时间阅读测序基因组学的进步社区,”Frank Pitzer说,总统罗氏测序解决方案。“我们正在积极努力让这些相同的长阅读发展上提供我们的台式GS 2014年初级系统。”

长的扩增子读长度是各种有针对性的测序应用程序的关键包括人类基因测序和病毒耐药研究以及微生物群落的分析。

早期的有针对性的测序结果16和18年代核糖体RNA基因准确配置混合社区显示扩展的扩增子读长度允许覆盖更多的可变区域在一个单一的阅读。bet188真人

这导致更精确的分类任务的生物属甚至种的水平,这是特别重要的微生物研究的临床研究。

早期访问测试最新的GS FLX +软件v2.9由著名宏基因组领域的研究人员也有流行的开源微生物群落分析工具优化QIIME和mothur最新长读取数据。

“GS FLX的新软件+系统将使研究人员能够获得相当长的时间序列读取从16 s rRNA基因扩增子不牺牲数据质量,”帕特里克城堡解释说,博士,助理教授mothur的密歇根大学和作者。

城堡继续说道,“这是一个很好的发展微生物生态学家,因为它将使他们得到更好的分类分类数据。”

除了促进微生物分析研究中,新的GS FLX +长扩增子将允许更全面的检测遗传变异的人类基因生成更多的内含子和外显子面板。

长还读提高单体型逐步远亲变异,这是至关重要的基因分型等高度多态的基因组区域的人类白细胞抗原(HLA)基因。

再扩增子读长度也明显缓解测序实验设计,工作流程,与分析通过允许优化引物的位置,使用更少的扩增子覆盖目标区域,和直接过渡的预先存在的桑格扩增子GS FLX +系统。