模拟+软件产品线延伸至分子药物设计

模拟+仿真和建模软件的领先供应商的药物发现和开发,发布了一个新的分子设计能力在美国化学学会全国会议上周在芝加哥。

这个新功能,Ron Creeley模拟+营销和销售的副总裁,说:“博士。软件产品经理David Miller ClassPharmer发现信息和我们的团队领袖,将解释下面的细节。

重要的是,我们已经开发出一种非常强大的方法生成新的分子结构对早期发现,我们相信将提供一个显著改善找到良好的艰巨的任务,新的药物类分子。通过结合新R-Table雷管与我们的顶级ClassPharmer ADMET预测软件,化学家们现在可以生成分子具有高达到目标的可能性,同时也接受ADMET性质。”

米勒博士解释说:“在过去,ClassPharmer常常被用于检查大量的分子实际上已被合成并运行通过高通量屏幕测量活动,如绑定到一个特定的蛋白质。ClassPharmer当时用于集群化合物成类,每个类,所有分子共享一个大型公共子结构。

化学家将下一个选择一个特定的类显示高活动为目标,并产生R-Table ClassPharmer提供了能力。R-Table页面显示了常见的子结构和一些附件点标记R1、R2、R3,等等。

页面也显示了一个表格,每一行的第一列中包含一个原始的分子,和列显示碎片附着在每个R位置的分子。这是一个常见的化学家所使用的工具。

”分子的集合,通过高通量运行屏幕,一个分子可能有一个特定的片段在R1,另一个在R2, R3和另一个。另一个分子可能有相同的片段在R1, R2和R3但全新的,等等。一些片段的组合R1和R2和R3并不存在。

“R-Table雷管使用所有可能的组合创造了新的分子结构的碎片在至少一个分子在每个位置。这种“爆炸”生成新的分子结构,属于同一高活动ClassPharmer生成的类,因为所有共享相同的常见的子结构。

“这种方法的重要性,新分子很有可能能够合成。合成可行性预测是困难的,但由于每个片段的爆炸已经合成在那个位置至少在一个分子,可能是新分子也可以合成。其他方法生成新的分子常常产生合成结构极其困难的或不可能的。

通过运行新分子通过我们ADMET预测软件,化学家也可以评估重要的物理化学性质和潜在的毒性,所以大部分的新分子通常可以排除,化学家可以集中注意的小子集是最有前途的。”

董事长兼首席执行官沃尔特Woltosz模拟+补充道:“这是一个令人兴奋的新功能,我们已经工作了几个月。它依赖于ClassPharmer生成类的核心力量,有很高的结构相似性,以及我们与行业领先的准确性预测ADMET性质的能力。我们相信这将增强的价值ClassPharmer和ADMET预测早期药物发现。”