单细胞技术推动基因组学的价值

生物学家正在寻求从少量的提取尽可能多的信息有价值的生物材料,生物反应和理解上级的决议。TGAC一直致力于减少DNA和RNA的输入要求到单细胞测序项目通过引入Fluidigm C1单细胞系统水平,FACs-in-a-petri CellSorter Labcyte回声微观液体处理程序。

为研究人员提供更好的基因组装配(通常限于贫穷输入DNA),并通过低输入和单细胞转录组,前所未有的理解细胞内生物化学变化以及如何模型。低输入和单细胞转录组策略有很大潜力协助多学科方法如细胞生物学、遗传学、基因组学、生物化学、病毒学、免疫学、系统生物学和最终合成生物学。

使用低投入大量的DNA和RNA需要专业设备,专业技术,精确的质量控制(QC),特别是预防和确定污染。选择特定的单个细胞本身就是技术上具有挑战性的,尤其是对各种各样的物种TGAC处理样品。作为回应,通过其独特的Fluidigm C1将促进需求自动微流体单细胞研究的方法。

Fluidigm C1平台是一个独立的自动化系统的混合细胞按大小分类并创建序列库。脊椎动物生物学的良好记录,和TGAC单细胞分辨率将用它来研究脊椎动物免疫系统如何回应抗原以改善农场动物疫苗接种战略。

FACS-in-a-petri系统跨项目的范围提供了灵活性和生物TGAC作品从混合物中选择特定的细胞外参数可能与C1。Labcyte回声525平台能够分发nanolitre卷试剂允许小卷库的生成成本最小化,最大化回报。

这些新资源将支撑的一系列研究项目利用基因组学的力量,产生广泛影响尽管许多不同的用户组。增强TGAC国家功能基因组学研究所支持的目标,使研究人员解决全球健康老龄化的挑战,食品和能源安全,可持续性和环境变化。

通过提供访问设备在一个多学科的方法,扩大TGAC不仅会进一步影响自己的研究,但也进一步加强其他机构的能力和研究激励机制在诺维奇研究公园。

Tarang梅赫塔项目领导和博士后研究科学家在脊椎动物和健康TGAC基因群,说:“这是美妙的,我们已经获得了这样的系统,不仅会促进“组学”技术发展,而且作为一种宝贵的资源为研究关键研究问题相关的动物,人类和植物健康和疾病。”

植物和微生物基因组学组长,马修·克拉克说:“这些技术开放机会了解生物学在越来越高的分辨率。我的团队期待使用解剖植物免疫转录对生物和非生物胁迫的响应。”

TGAC也增强方法寻找基因组测序和组装大型基因组。专业代长片段的DNA提取协议可以是昂贵的,困难的,需要特定的设备和涉及使用低温学和化学危险品。这些需求和缺乏训练有素的人员可能导致质量和延迟项目的妥协。

极光北方基因组学将协助DNA提取制备所需的高品质,高分子量DNA库。它可以快速DNA一样大60 kb大小和尺寸选择DNA分子在100 kb分离较小的片段和抑制化合物。

集成的系统可以通过快速量化,促进高通量DNA提取QC和精确的大小选择。挑战性的样本,TGAC还增加了与他们的门店技术套件,一个3 d扫描仪和打印机扫描结合现有plasticware如样品盘子,磁铁持有人等和快速原型匹配TGAC新修改的需求在DNA提取。

丹尼尔天鹅,TGAC平台和管道主管,说:“继续投资前沿平台TGAC意味着我们独特的地址与复杂的基因组学项目相关的挑战,我们期待着打开平台广泛的研究团体。”