西班牙的研究小组使用罗氏的GS FLX +系统

一个研究小组从医院拉巴斯大学研究所(IdiPAZ,马德里)LifeSequencing S.L.(瓦伦西亚),Era7生物信息学(马德里)和罗氏西班牙(巴塞罗那)已宣布整个基因组的测序三种抗生素耐药菌株的克雷伯氏菌pneunomiae隔绝在西班牙医院最近的一次爆发。

生成的序列数据,使用罗氏的454 GS FLX +系统,是第一批这个特定的细菌种类,提供新的深入了解抗生素耐药性的发展在这个微生物,并可能导致医院暴发。

肺炎克雷伯菌是一种细菌经常发现口腔和肠道健康的人类。在大多数情况下,它不会导致疾病,但可以伺机突变并导致不同类型的感染。

细菌也有一个重要的能力获得抗生素耐药性。

三个密切相关的致病菌株的分离k .肺炎抗生素耐药性的增加程度得到拉巴斯大学微生物学系的医院和测序LifeSequencing在瓦伦西亚,西班牙使用长读GS FLX +系统,罗氏公司开发的454生命科学。

测序数据组装使用GS新创汇编软件和功能注释进行识别相关基因与BG7编入三个基因组中,优化系统时代7生物信息学,提供丰富的功能注释454测序数据。

研究人员发现,这三个细菌菌株显示越来越广泛的抗生素耐药模式最常用在医院。

基因组的比较将发表见解在k .肺炎和抗生素耐药性的发展将如何帮助努力减少全世界日益流行的抗生素耐药性。

此外,这些基因组的比较与其他先前研究将有助于了解微生物,细菌是我们正常的一部分微生物可以成为一个危险的病原体。

“快速和廉价的测序的病原菌是一个巨大的定性和定量推进,从根本上改变了研究者和临床医生认为传染病的过程,”博士说耶稣Mingorance首席研究员在医院拉巴斯大学。

GS FLX +和GS初级系统从罗氏帮助在这些病原体检测和细菌全球比较基因组学的努力。