提高免疫系统的数据管理和分析

ENPICOM,生物信息学软件工程公司已经宣布的主要版本ImmunoGenomiX (IGX)平台。这个平台的目的是简化的分析和管理大量的曲目测序数据,加速新生物的发现和开发目标。

增加对新疫苗和精密医学的需求,以及减少投放市场的预期,导致一个根本性转变新药开发。来满足今天的需求个性化的免疫疗法和访问疫苗,特别是对新兴威胁COVID-19一样,生命科学家必须有高效的数据管理和分析工具,可以让他们获得更多的洞察自适应免疫系统。

免疫曲目测序提供了一个深入的适应性免疫系统,是最翔实的分析方法。然而,曲目测序实验通常产生数以百万计的每个样本测序读,和公开数据的数量是呈指数增长的。有效帮助研究人员管理和理解这些数据,ENPICOM已经开发了一个可伸缩的、通用的工具——IGX平台。

IGX平台发布的2019年4月,是一个端到端的解决方案有效的管理、分析和可视化的T细胞和B细胞受体测序数据。强大的数据处理功能,直观的用户界面,和一些分析应用程序,它可以帮助科学家在学术研究中心和生物制药公司准确地解释大型曲目数据,减少所需的时间提取生物和临床相关的见解,最重要的是,可以帮助解锁的见解,否则被隐瞒。

版本2.0的发布,IGX平台现在支持不仅大部分还单细胞测序数据,允许用户配对的互补利益链信息。管理和分析数据的能力从散装和单细胞工作流环境immunomics研究和药物开发提供了前所未有的机遇。ENPICOM IGX平台简化了分析过程,有效地减少数据集成困难和科学产出最大化。

2.0其他知名IGX平台的特性和增强功能包括:

• 新的IGX-Compare应用-受体序列的内部和外部数据集包含很多有价值的信息。然而,由于这些数据的数量和复杂性,探索和解释是一个具有挑战性的和费时的过程。IGX-Compare,用户可以轻松地比较任意两个数据集和可视化并优先匹配的克隆,例如,通过匹配单个克隆与外部数据库或通过两组病人内部之间的重叠。
  
  
• 更广泛的数据支持——容易的平台现在支持上传带注释的克隆表(例如在CSV、TSV),例如,10倍基因组学或自适应生物技术。这意味着用户可以在平台和分析现有项目导入到他们的数据通过一个直观的用户界面。
  
  
• 更多clonotype分组定义-用户可以选择多个clonotype定义组受体序列。例如,他们可以在CDR3上氨基酸组,或CDR3上核苷酸序列,给他们更多的控制他们选择如何看待和分析他们的数据。
  
  
• 新的V / J基因使用阴谋——基因片段定义抗原识别中发挥重要作用。IGX-Explore现在提供一个交互式的可视化V / J基因的使用,用户可以发现优惠使用V / J基因,从而突出了V / J基因家族参与某些疾病或表明抗原疫苗研究中克隆的扩张。