与软件公司SilcsBio Sygnature发现宣布合作

Sygnature发现,领导独立整合药物研发和临床前服务公司今天宣布了一项与SilcsBio合作,科学软件公司专注于高通量完全蛋白质的原子论的模拟目标和protein-ligand结构。

SilcsBio为Sygnature提供了进入其SILCS由配体竞争饱和(网站识别)和SSFEP(单步自由能微扰)软件。Sygnature的研究人员现在可以为客户提供的好处这些强大的技术在药物发现项目。

SILCS软件识别蛋白质的表面结合位点热点。可能,这可能包括“神秘口袋”——结合位点的结构信息是可用的。SILCS方法包括进行分子动力学模拟的蛋白质在水溶液中化学性质不同的小分子。这个片段类型的生成概率分布,称为FragMaps。可以使用这些FragMaps迅速,以最少的计算费用预测或完善配体绑定姿势,定量评分配体结合口袋里,生成多个receptor-based药效团模型用于虚拟筛选活动。这已被证明是更有效的比标准对接技术研究或receptor-based药效团模型。

以互补的方式,SSFEP软件已经证明成功排名化合物亲和力绑定到目标蛋白质。特别是SSFEP方法是大约1000倍的速度比聚全氟乙丙烯的方法使用的更广泛。它能达到这个速度后处理配体分子动力学仿真数据,并使用它来估计炼金术的自由能改变配体的化学修改。

这样的快速评估药物设计团队的想法可能有利于加快design-test-optimise周期。能够评估和优先考虑在几天的设计思想可以在基于结构的设计产生重大影响的项目。

在过去的六个月中,Sygnature SilcsBio软件套件成功地应用于各种hit-to-lead和铅优化项目。该公司认为这些新的软件工具将为其客户提供实实在在的利益,尤其是因为节省了时间的软件可以提供。

SILCSBIO软件成功的例子包括:

•神秘/瞬态绑定在GPCRs口袋检测,核受体和其他跨膜蛋白
•显示未知的绑定的口袋,让客户更有效的配体的设计
•预测晶体绑定模式的客户新设计的抑制剂
•提供重要的见解来驱动BCL6抑制剂的药物化学细化
•2019年NIH奖基金扩张的SILCS软件,使其使用生物疗法,尤其是对赋形剂的设计

“我们高兴与Sygnature发现合作带来的好处我们的药物设计软件Sygnature的项目和客户。这种合作对我们很有意义因为Sygnature仍然是一个伟大的伙伴,它打开了新的市场大门SilcsBio”肯•马龙表示,首席执行官SilcsBio。

“SilcsBio软件套件,以其强大的基于物理算法和用户友好的界面,提供了强大的影响力,基于结构的药物设计领域,使我们能够迅速验证新的想法/假说”评论比尔Tatsis计算化学家Sygnature发现。