针对蛋白质组学与diaPASEF工作流

力量已经宣布释放diaPASEF工作流,小说data-independent收购(DIA)方法timsTOF职业平台。timsTOF Pro利用困离子迁移谱法(蒂姆斯)和“并行-串行积累碎片”(PASEF),在一个密集的合作开发集团多年的马克斯普朗克研究所马提亚曼教授。

新diaPASEF工作流使用重叠的窗口在离子迁移域触发/女士,女士使用四极有效地传输前体离子在高灵敏度。使用PASEF的固有频宽比优势,diaPASEF通常导致蛋白质识别进一步提高30%,现在超过7500蛋白质中确定一个120分钟的单发实验200 ng希拉消化。diaPASEF也减轻所谓的随机缺失值问题”,视数据采集(DDA)的方法,从而提高数据完整性和敏感性。

除了更有效离子diaPASEF使用,传统DIA方法相比,离子迁移率的timsTOF Pro提供了额外的维度,或碰撞截面(CCS),所有CCS-aware现在利用蛋白质组学的软件解决方案。除了保留时间对齐,timsTOF Pro还允许同时离子流动对齐diaPASEF前体和片断,进一步提高作业的可靠性和特异性。

进一步结果的定量性能diaPASEF将会在2019年国际:使用label-free量化(LFQ)三个蛋白质组的混合物(海拉、酵母、大肠杆菌)和Spectronaut软件,超过8000种蛋白质可以可靠地识别和量化与至少两个肽错误发现率为1%。

罗马菲舍尔博士,首席研究员纳菲尔德医学系的,牛津大学的目标发现研究所说:“与PASEF timsTOF Pro的到来彻底改变了比赛临床蛋白质组学。突然我们可以扩大临床研究10 x倍或者更多,甚至改进的健壮性,数据深度和完整性。我们兴奋的前景diaPASEF梯度较短的为我们的临床研究”。

在制品小说3 d-targeted人口、难民和移民事务局工作流与额外的离子迁移率目标

目标定量蛋白质组学,力量也引入了一个新颖的3 d-targeted平行反应监测(人口、难民和移民事务局)方法在timsTOF Pro在制品在国际2019。在传统的2 d人口、难民和移民事务局的实验中,使用保留时间和质量目标和量化目标蛋白质生物标记的列表。问题2 d人口、难民和移民事务局是干扰肽co-elute具有类似前体群众可以co-fragmented,可以减少量化性能,特别是定量下限附近复杂的矩阵,如等离子体。

timsTOF Pro的4 d蛋白质组功能现在可以在三维空间中目标蛋白,即保留时间和质量,加上由环球,molecule-specific CCS和精确值。这些额外3 d-targeting人口、难民和移民事务局在离子迁移率,结合蒂姆斯/ PASEF、提供的敏感性增强,> 100 Hz MS / MS速度50000质量分辨率timsTOF Pro,意味着更多的蛋白质可以通过人口、难民和移民事务局的3 d-targeted敏感性和定量。

加里Kruppa博士,力量的副总裁蛋白质组学,与diaPASEF表示:“我们希望加快发展的新应用程序和更令人兴奋的结果。快速的和用户友好的软件的开发库生成和分析结果采用diaPASEF也是关键。我们很高兴有如此广泛的支持diaPASEF软件从我们的合作伙伴。结合新发展3 d-targeted人口、难民和移民事务局为蛋白质组学,timsTOF Pro涵盖更多CCS-aware 4 d蛋白质组学ˮ工作流以独特的方式

3日力量已经开始与早期采用者合作d-targeted人口、难民和移民事务局定量蛋白质组学与新的beta版评估性能和获得用户输入。

Jarrod博士,dana - farber癌症研究所副教授,哈佛大学医疗中心和布莱根妇女医院表示:“我们感到兴奋与力量结合first-in-class收购与离子迁移速度,推动新的3 d-targeted人口、难民和移民事务局工作流timsTOF Pro。我们的初步结果很有前途,我们很高兴与合作推动人口、难民和移民事务局新的性能水平。”