沃特斯引入蛋白质组学研究的新功能

沃特斯公司发布了其ProteinLynx™Global SERVER软件版本，其中包括对沃特斯的增强功能^®蛋白质表达系统，在生物分子资源设施协会(ABRF)年会上，2月11日至14日。

Waters®ProteinLynx Global SERVER™(PLGS) 2.2.5软件提供了新的工具，使研究人员能够有效地识别和量化蛋白质和生物标志物。

沃特斯公司声称，沃特斯蛋白表达系统采用PLGS技术，是第一个不使用同位素标记技术的实用定量蛋白质组学商业产品。

PLGS 2.2.5扩展了这项技术，改进了算法，用于在大型患者/样本集或时间过程研究中有效地定量和识别蛋白质。

PLGS中的一个新的定量模块旨在允许使用任何商用或用户定义的标记技术(如SILACTM, AQUATM, ICAT)在蛋白质或肽水平生成定量数据^®iTRAQTM等。

现在，PLGS能够执行“无标记”和“同位素标记”方法，这意味着它为分析不同类型和复杂性的蛋白质组学样本提供了无与伦比的灵活性。

PLGS 2.2.5提供了在复杂样品中有效识别蛋白质的能力的“阶跃变化”，通过结合一种算法，该算法旨在使从Q-Tof型质谱仪获得的MSE数据(E -提高碰撞能量)中识别蛋白质。

在LC/MS实验中，采用了专有和专利的“并行”肽碎片协议，为蛋白质消化中所有可检测到的肽提供100%的占空比。

与传统的“数据依赖采集”(DDA)质谱/质谱方法相比，这种方法可以显著提高蛋白质鉴定的序列覆盖率和置信度。

PLGS 2.2.5的其他增强包括新的数据可视化工具，可以直观地描述在大量样品或条件下蛋白质浓度的变化。

最后，对于在科学期刊上发表科学发现的研究人员来说，PLGS 2.2.5将可以访问许多流行的格式，包括峰值列表、可扩展标记语言(XML)和人类蛋白质组织(HUPO)蛋白质组学标准质谱计划所要求的mzData格式。

在2006年ABRF上引入的这些和其他增强功能将在311号展位上进行讨论，并在科学会议期间的几张海报上进行讨论，这些海报将在会议结束后的会议上发布网站．