快速，高效的样品制备的ms - s蛋白质组学应用

基于ms的蛋白质组学应用的样品制备方法尚未标准化，许多样品需要长时间处理，可能导致低肽产量、低消化效率和低重复性。新的Thermo Scientific™EasyPep™样品制备试剂盒，提供了一个易于使用的开箱即用的解决方案，具有优化的工作流程，显着减少了从完整细胞到清理肽的总样品处理时间(不到4小时)的实际操作时间。可在多种格式支持广泛的输入量，这些试剂盒是理想的样品制备从细胞，组织，血清和血浆广泛的应用，包括无标签定量，靶向分析，并兼容下游应用，如高ph反相分馏，磷酸肽富集和TMT™试剂标记。

在本应用笔记中，我们比较了三种EasyPep格式(Mini, Maxi和96孔)处理不同类型的样本，包括人类细胞系，人类血清/血浆，酵母，大肠杆菌，新鲜组织，和福尔马林固定，石蜡包埋(FFPE)组织，并表明所有三种格式产生相同的蛋白质和肽id与不同的样本类型和规模。此外，我们还演示了EasyPep MS样品制备化学与下游应用的兼容性，包括使用Fe-NTA树脂和Thermo Scientific™串联质量标签™(TMT™)试剂在消化前后进行磷酸肽富集。

Thermo Scientific™EasyPep™样品制备套件提供的优化和标准化的工作流程使新手和专家用户能够快速采用。