从有限总RNA构建高质量RNA- seq文库
下一代测序(NGS)应用的一个始终存在的挑战是从低量的起始材料中获得高质量的数据。生成RNA-Seq文库所需的大量处理步骤在每个酶处理和清理步骤中对材料的效率和保留提出了额外的挑战。在这里,使用从人类细胞系分离的总RNA稀释系列来检查NEXTflex™Poly(A) Beads和NEXTflex™Rapid Directional RNA- seq Kit用于mRNA分离和文库制备的稳健性。分析了文库质量的几个指标,包括唯一reads、核糖体RNA污染和检测到的转录本数量,以确定低输入总RNA样本的质量。数据表明,使用NEXTflex Rapid Directional RNA- seq试剂盒,仅用10 ng总RNA就可以生成高质量的文库。
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