比如技术新一代测序(NGS)在过去十年中不断发展，我们对人类微生物组的理解也在不断发展，人类微生物组是指居住在人体中的大量细菌、病毒、真菌和其他微生物。正如微生物组的组成在任何时候都在组织内部和组织之间变化一样，它也在我们的一生中进化和变化。
因为人类出生时是“不育的”——也就是说，没有微生物群——一个需要解决的重要问题是:婴儿何时以及如何获得其微生物群?“我们团队和其他人的研究已经将微生物组的发展与健康结果联系起来，包括过敏、肥胖和炎症性疾病(例如糖尿病和炎症性肠病)。因此，研究微生物群是如何发育的以及哪些因素影响发育是很重要的。Wouter de Steenhuijsen Piters他是荷兰乌得勒支大学医学中心的医生和数据科学家。
之前的研究已经探索了分娩方式是否会影响婴儿的微生物群，有证据表明，顺产出生的婴儿与剖宫产出生的婴儿具有不同的肠道微生物。来自威康桑格研究所领导了一项合作研究发现虽然阴道出生的婴儿从母亲那里获得了大部分肠道细菌，但剖宫产出生的婴儿却没有。相反，这些婴儿携带了与医院环境相关的肠道细菌。数据也表明婴儿出生后是母乳喂养还是配方奶喂养是婴儿肠道微生物群组成的重要决定因素。
到目前为止，很多研究都集中在肠道微生物组但我们身体的其他部位也携带微生物，包括呼吸道，皮肤而且生殖器．在婴儿期，肠道以外的其他微生物群是如何发育的，哪些因素可能会影响它们的发育?
在乌得勒支大学医学中心，de Steenhuijsen Piters的工作主要集中在婴儿气道微生物组。他说，这种微生物群的“正常”发育异常与增加呼吸道感染的易感性．像肠道微生物组一样，婴儿气道微生物组也可以由婴儿的分娩或喂养方式决定。
de Steenhuijsen Piters领导的一项新研究发表在细胞宿主和微生物，它全面探索了微生物群在生命的第一个月是如何发展的。研究人员收集了120名荷兰母亲的皮肤、母乳、鼻子、喉咙、粪便和阴道微生物组样本。他们还从婴儿身上收集了婴儿出生后两小时、一天、一周、两周和一个月时的皮肤、鼻子、唾液和肠道微生物组样本。
188金宝搏备用采访了de Steenhuijsen Piters询问研究人员采访系列。我们想知道:根据新的研究，剖宫产婴儿会错过必要的微生物吗?而且，婴儿的微生物群有多大比例来自母亲?
莫莉·坎贝尔(MC):你的研究旨在了解婴儿微生物群是如何在身体的不同部位发育的，以及这是如何受到出生方式、抗生素使用和缺乏母乳喂养等因素的影响。你能总结一下你进行这项研究的方法吗?
Wouter de Steenhuijsen Piters (WSP):我们对120对母婴进行了前瞻性出生队列研究。我们从母亲身上采样了多个身体部位(即阴道、母乳、粪便、鼻咽(鼻后)、唾液和皮肤)以及婴儿(即粪便、鼻咽、唾液和皮肤)。
这使我们能够追踪母亲和婴儿之间的微生物。这项研究的特别之处在于，我们可以从婴儿出生开始取样，所以第一批样本是在婴儿出生两小时后采集的。此外，我们在出生后一天、一周、两周和一个月采集了样本。
MC:你的数据表明，无论出生方式如何，婴儿体内大约60%的微生物来自母亲。你能更详细地讨论一下这一发现吗?以及它对母亲和她们的后代的重要性?
WSP:事实上，我们发现婴儿的微生物群都受到多个母体微生物群的影响。利用数学模型，我们试图以不同的分数“混合”母亲的微生物群，目的是最终得到婴儿的微生物群。使用这种方法，我们可以解释大约60%的婴儿微生物群，这表明母亲在为婴儿提供细菌源群落方面非常重要。bet188真人
母亲身体的多个部位会影响婴儿的微生物群，这一事实有助于这样一种观点，即如果其中一个来源不能提供微生物，孩子可能会从其他来源获得“更多”的微生物。这是我们对母乳微生物群的观察，在剖宫产出生的婴儿中，母乳微生物群对婴儿(粪便)微生物群的贡献更大。
主持人:那婴儿体内另外40%的微生物群呢?我们知道它们是从哪里来的吗?
WSP:不，我们不知道太多细节。我相信试着理解这40%是怎么来的会很有趣。我的建议是，它来自于环境(可能是宠物)、父亲、兄弟姐妹或其他照顾者。
MC:有吗?任何在研究中确定的情况下，婴儿可能会“错过”必要的微生物?
WSP:考虑到肠道微生物群，我们发现剖腹产出生的孩子缺乏一种叫做拟杆菌此前，这与健康状况有关。我们的数据表明，这种细菌无法在儿童体内存活较长时间，因为它缺乏其他依赖的支持物种，这些支持物种可能不会从母亲传给孩子。
此外，我们知道——主要是基于先前基于同一出生队列的研究——剖宫产出生的儿童患乳腺癌的几率更小棒状杆菌属而且Dolosigranulum在他们的上呼吸道，这与生命的第一年呼吸道感染的增加有关。答案并非非黑即白。婴儿并没有完全失去微生物，但可能会接受较少数量的特定细菌。
“这是一项健全且非常全面的研究，研究人员调查了出生后微生物从母亲传播给孩子的途径。这项研究的作者非常仔细地检查了120对母婴在生命最初几周内的各种皮肤和粘膜壁龛。在此过程中，他们不断检查母亲的微生物积聚在孩子的哪个生态位，以及它们来自哪个资源生态位。”说克里斯托弗教授Härtel德国Würzburg大学医院儿科诊所和综合诊所主任，他没有参与这项研究。
MC:这项研究有什么你认为有必要强调的局限性或缺陷吗?
WSP:该研究的优势包括探索的大量身体部位和婴儿样本的纵向采样。此外，我们在出生后直接采集样本，这在我们的研究领域是罕见的。
我们本可以使用更先进的测序技术(例如宏基因组测序)来更好地评估微生物传播。此外，随着时间的推移，包括母亲的样本也会很有趣，以评估分娩前后母亲微生物群的动态。
MC:你们在这个研究领域的下一步是什么?
WSP:除了了解婴儿体内另外40%的微生物从何而来，wE的目标是对我们的队列进行长达五年的跟踪，以了解早期微生物群传播与长期健康结果(例如哮喘、喘息表型和肺功能)之间的关系。
合适的“入门套件”
Debby Bogaert教授他是爱丁堡大学的内科科学家，也是这项研究的第一作者。在一个新闻稿，她解释了这项研究的发现如何从进化的角度“有意义”:“微生物群的转移和发育是如此重要，以至于进化确保了这些微生物以一种或另一种方式从母亲转移到孩子身上。”她补充说:“对于剖腹产出生的孩子来说，母乳喂养变得更加重要，因为他们没有从母亲那里获得肠道和阴道微生物。”
“这是一个聪明的系统，从进化的角度来看，这些类型的途径是多余的，以确保孩子能够以适当的‘入门套件’开始生活，”德·斯蒂恩惠森·皮特斯总结道。
博士。Wouter de Steenhuijsen Piters采访对象是科技网络的高级科学作家莫莉·坎贝尔。188金宝搏备用
