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是什么导致美国冠状病毒检测试剂短缺?

信贷:Pixabay

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采取积极行动应对COVID-19疫情的国家可以在遏制这一致命病毒的传播方面取得强劲进展,并帮助“拉平曲线”。在冠状病毒等疫情爆发的初始阶段,会采取隔离、追踪接触者和保持社交距离等措施来控制其传播;然而,如果无法检测和识别疑似病例,这些措施的作用有限。

世界卫生组织(卫生组织)敦促各国加强对COVID-19的检测.世卫组织总干事谭德塞(Tedros Adhanom Ghebreyesus)表示:“预防感染和拯救生命的最有效方法是打破传播链。要做到这一点,你必须测试和隔离。你不能蒙着眼睛灭火,如果我们不知道谁被感染,我们就无法阻止这场大流行。我们要向所有国家传递一个简单的信息:测试、测试、测试、测试。”

在任何流行病中,检测正确的人都是一个至关重要的方面。除了挽救生命外,广泛的检测还可以提供模拟疫情过程所需的重要数据。试剂是检测的关键组成部分。不幸的是,许多美国实验室难以获得进行大批量冠状病毒诊断检测所需的试剂。

美国的COVID-19检测

在美国疾控中心为公共卫生实验室提供检测包对新型冠状病毒进行实时rt - pcr检测。疾病预防控制中心4日从美国食品药品监督管理局(FDA)获得了使用rRT-PCR检测的紧急使用许可(EUA)。

疾控中心的检测试剂盒可通过国际试剂资源(IRR)这是疾控中心设立的专门单位,为注册用户提供研究和检测病原体(如引起COVID-19的病毒)的试剂、工具和信息。在IRR中集中这些功能的目的是确保试剂的使用和获取受到监测,并确保质量控制。FDA规定,进行冠状病毒检测的临床和商业实验室可以从已获得FDA EUA的商业试剂制造商那里获得检测试剂。

在美国的公共卫生实验室进行的测试收到以下试剂来自CDC的国际试剂资源(IRR):

  • 用于标本制备的设备和提取试剂盒,包括QIAGEN和Roche的试剂盒
  • rt - pcr检测试剂盒,包括检测导致COVID-19的病毒的检测试剂
  • 赛默飞世尔(Thermo Fisher)的混合试剂盒,包含进行PCR测试所需的酶和其他成分
  • 人体标本控制
  • EUA阳性对照

RNA提取试剂盒短缺


在美国,随着确诊的冠状病毒病例数量的增加,广泛报道了用于分离病毒RNA的试剂短缺的情况。RNA提取是进行冠状病毒检测的第一步。根据美国微生物学会3月10日发表的一份声明“一个已经曝光的挑战是SARS-CoV-2 PCR试剂的供应短缺。我们深感关切的是,随着未来几周检测数量的急剧增加,如果没有这些关键组件,临床实验室将无法部署它们。”

美国疾病控制与预防中心(CDC)开发的新冠病毒检测试剂盒涉及逆转录-聚合酶链反应。FDA推荐QIAGEN和Roche的RNA提取试剂盒和程序用于RNA的回收和纯度,用于CDC 2019-nCoV实时RT-PCR诊断面板。的套件短缺包括QIAGEN QIAamp病毒迷你试剂盒和QIAGEN EZ1病毒迷你试剂盒以及罗氏MagNA纯核酸试剂盒。的RNA提取试剂供应短缺已经阻止了实验室准备样本进行测试,这反过来又推迟了测试结果。


是什么导致了短缺?


疾病控制中心的检测工具出了问题

最初,美国食品药品监督管理局(FDA)独家授权疾控中心进行新冠病毒检测。

今年2月,美国疾病控制与预防中心推出了COVID-19的三步诊断测试,并将测试包分发给了近百个州和地方实验室.但大多数实验室都面临着阴性对照失败和结果不确定等问题。2月12日,疾控中心正式宣布这个问题是由错误的试剂引起的。该机构保证解决问题,重新制造有问题的部件,并将其分发给公共卫生实验室;然而,在这一关键时刻,美国疾病控制与预防中心缺乏检测试剂盒,阻碍了在疫情早期进行更大规模的检测。

确定测试对象的标准

最初,美国疾病控制与预防中心仅建议对那些有发烧和/或下呼吸道症状、去过中国武汉或与疑似或确诊的冠状病毒病例有过接触的人进行检测。然而,在2月底,一名患者在没有旅行史或已知接触史的情况下被感染后,美国疾病控制与预防中心修改了其指南,将因呼吸道疾病住院的发烧患者包括在内。这一变化增加了接受检测的患者数量,从而迅速增加了对试剂的需求。

样本采集

疾病预防控制中心最初建议采集两个样本拭子用于测试,这就意味着试剂的使用超出了必要的范围。


为加强检测而采取的行动


鉴于公共卫生紧急情况,2月29日,FDA发布了紧急使用授权(EUA).通过EUA,该FDA专员可能会允许未经批准的医疗产品或未经批准使用未经批准的医疗产品,用于在没有足够的、批准的和可用的替代品时,在紧急情况下诊断、治疗或预防由化学、生物、放射性和核(CBRN)威胁引起的严重或危及生命的疾病或状况。

根据FDA 2月29日发布的指导意见,经CLIA认证可进行高复杂性检测的实验室在验证后可在获得FDA授权之前使用自己的COVID-19实验室开发的检测方法。实验室将有15天的时间提交一份完整的紧急使用授权请求。如果获得授权,EUA意味着该COVID-19诊断可暂时授权使用,直到公共卫生紧急事件终止或EUA被FDA撤销。

3月16日,FDA更新了2月29日发布的政策.虽然导致CLIA认证实验室获得EUA的政策保持不变,但对于在CLIA下认证的实验室,有了新的国家授权政策。根据更新,当检测由实验室所在州的当局开发,并且该州负责该州实验室的COVID-19检测时,FDA不打算反对实验室在未向FDA提交EUA请求的情况下将此类检测用于样本检测。

以下是最新的(截至3月20日)EUAs名单FDA发布的在体外用于检测导致COVID-19的病毒的诊断。

  • 新型冠状病毒实时RT-PCR诊断板(CDC)
  • 纽约SARS-CoV-2实时逆转录酶(RT -PCR)诊断板(纽约州卫生部Wadsworth中心)
  • cobas SARS-CoV-2(罗氏分子系统公司)
  • TaqPath COVID-19 Combo Kit(赛默飞世尔科学公司)
  • Panther Fusion SARS-CoV-2 (Hologic, Inc.)
  • COVID-19 RT-PCR检测(美国实验室公司)
  • Lyra SARS-CoV-2检测试剂盒
  • Quest SARS-CoV-2 rt - pcr (Quest Diagnostics Infectious Disease, Inc.)
  • 雅培实时SARS-CoV-2检测(雅培分子)
  • Simplexa COVID-19 Direct (DiaSorin Molecular LLC)
  • ePlex SARS-CoV-2检测(GenMark Diagnostics, Inc.)
  • COVID-19基因实时PCR检测(Primerdesign Ltd)
  • Xpert Xpress SARS-CoV-2检测试剂盒(造父变星)


FDA也发布了一份常见问题页面关于冠状病毒诊断检测,列出了潜在的替代试剂、提取方法和CDC检测所需的替代平台。

3月13日,美国疾病控制与预防中心修订了样本采集建议,现在建议进行检测只采集一个拭子(单个上呼吸道鼻咽)而不是两个.这一修订将把检测所需的试剂数量减少近50%。

随着替代检测方法和试剂的迅速提供,以及标本收集的简化,试剂短缺预计将不再是未来几周检测的障碍。然而,实验室现在也在努力解决个人防护装备和检测棉签等基本用品的短缺问题。

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Neeta Ratanghayra, MPharm
Neeta Ratanghayra, MPharm
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